肛瘘容易复发，这是不争的事实，到底是什么原因造成的?复发不仅是治疗失败，由于瘘管的完整性遭破坏和手术留下的瘢痕，将给再次手术增加较大难度，也将对肛门的括约功能造成严重影响。因此，分析失败原因，尽量争取一次手术成功有极其重要意义。
1、高位瘘管未处理
由于高位肛瘘涉及肛直环，担心手术切开或挂线后，导致便失禁，所以常常只切开齿线下的瘘管，深向直肠腔的瘘管未予处理。这是笔者在临床上遇到复发病例最多的一种情况。向上的这段瘘管无论如何换药，就是反复感染，往往再次手术方法不当，术后还是复发。
下面介绍两个病例:
这是2年前我在贵州会诊治疗的一个病例。患者季某，男，48岁。肛瘘，已在当地由不同的医生手术了6次，但还是不好，患者忍无可忍，坚决不让当地的医生动，并让院方保证第7次手术必须成功，否则就要“告官”。我检查后认为手术失败的原因正是因为是高位瘘，向上至少还有4cm的瘘管没有处理。在和患者沟通后，他放弃“必须治好”的最后通牒，接受了第7次手术。方法采取双向等压引流方法。在瘘管的顶端人工造口，内口适当向上切开，然后置入4根丝线，紧线但不切断瘘管，嘱2周后拆掉丝线，瘘管会自然愈合。2个月后电话随访，完全愈合，院方表示感谢，称解决了他们的一个大难题。
另一个病例，小莫，24岁，肛瘘，来自湖南衡阳。两年来他基本都是在医院度过，从2010年7月以来，他先后在当地两家医院接受四次手术治疗，饱受煎熬。2012年8月11日当地最后一次手术后，仍不见好转，当地医生在转院单上这样写道：“术中探针探入6cm，刮除出大量坏死组织，肛瘘内口斜向上穿过括约肌。切扩外口，挂线引流。目前创面缩小，但窦道仍不能愈合，考虑病情复杂，多次手术未愈，建议患者去上一级医院就诊”。入院检查见，肛门右侧、后侧大面积瘢痕形成，考虑是多次手术留下的，表面有两处溃疡面，创口留有一根皮筋未脱落。肛内指诊，肛直环僵硬，皮筋上方直肠下端触及瘢痕条索，按压，有脓液流出。诊为高位复杂性肛瘘。
认为此前四次手术解决了肛缘外低位瘘管的问题，对直肠内的高位瘘管未能合理处理，导致复发。2012年11月15日，予以行双向等压引流处理，2012年11月27日，拆线，撤管，2012年12月4日康复出院。20天时间解决折腾他两年的病魔。
2、方法不当
有些手术方法目前还处于探索阶段，效果不确定，术后复发的可能性要大。
山东烟台的王先生，从一年前患脓肿起，在当地已经三次手术，可这病情没有一点好转还加重了。原来就一处病灶，现在已经发展到半侧臀部好几处外口。第一次手术是脓肿切开引流，第二次是内口闭合术，第三次是PPH术。
PPH是治痔疮的，怎么会用来治疗肛瘘，术者的解释是封闭内口。三次手术失败后，术者让患者不要吃饭，说不吃就不拉，不拉内口就不会感染，这样也许能好。但最终的结果是不得不再做第四次手术。
3、内口定位错误
内口是肛瘘的感染源，肠腔的致病菌正是从内口进入肛周才引起肛周脓肿和肛瘘的，一般位于肛门内3～4cm处的直肠和肛管交界处。外口是感染病灶的溃破口，多数在肛缘外，也有少数在肛内。肛瘘手术的成败最重要的因素在于准确定位内口和充分切开内口。
肛瘘外口多是显性的，内口则90%以上是隐性的。临床上寻找内口的最主要方法是从瘘管内探查或指诊触摸。由于很多肛瘘迁延日久，瘘管内反复感染形成粘连而堵塞不通，就无法通过探查和造影的方法来寻找。对于瘘管弯曲、多外口的复杂瘘同样也无法探查。如果没有一定的临床经验，没有掌握肛瘘内口的形成规律，往往在术中只切开了部分瘘管，真正的内口仍存，导致术后复发。
4、挂线术盲目人为制造内口
挂线术是中医传统疗法，也是目前临床治疗肛瘘采用的最主要方法，其原理是利用胶线的弹力收缩，慢性勒割管壁，敞开瘘管而起到治疗作用。但我们发现挂线术不仅存在痛苦大、愈合时间长、对肛门括约肌损伤重等缺点外，还有相当高的复发率。
无论是早期的瘘管壁全部挂线还是现在的切挂，其方法都是将胶(丝)线从肛瘘外口穿入瘘管，然后从内口拉出，收紧线的两端并结扎在一起。如果瘘管畅通，线开从内口准确拉出，瘘管壁被完整打开而获得治愈，但如果瘘管中间粘连或内口闭合，在穿线过程中就很有可能穿出管壁进入瘘管外组织，然后从人为的穿破口出来，这样，部分关键的瘘管和内口就被遗漏而没有打开，从而造成手术失败，术后复发。
5、主灶未敞开
何谓主灶?主要的病灶，按照瘘管不同部位对治疗的重要性，我们将瘘管分为主灶和支管，主灶是由内口及与内口相连的肛管段瘘管，也是和肛门内外括约肌相伴而行的瘘管。在治疗上，主灶一定要切开。外口及与其相连的肛缘外瘘管叫支管，在治疗上，支管只要引流通畅而不必全部敞开。由于多种原因，我们在手术时或没有找到主灶或顾忌损伤括约肌影响肛门闭合功能而未能充分敞开主灶，结果创口始终不能愈合，或暂时愈合后又溃破复发。
6、遗漏支管
肛瘘手术时主灶切开重要，支管引流同样重要，如果在术中遗漏支管而没有处理，同样会造成手术失败，这种情况多发生在复杂性肛瘘和病程较长反复发作的肛瘘。复杂性肛瘘支管多，瘘管弯曲，反复发作的肛瘘瘢痕重，这都给寻找支管造成困难，术中极易遗漏而形成残存窦道，术后会反复感染不愈。
7、引流不畅
肛瘘治疗时不管是手术还是挂线，最终目的都是达到引流通畅目的，只有引流通畅瘘管才会脱落，创口肉芽才会正常生长，皮肤才会顺利覆盖。瘘管过深，切口过小过短而又没有放置引流物，或行支管旷置术时方法不当，都会造成引流不畅，创口不愈合。
8、术后假愈合
术后换药是肛瘘手术治疗的一个重要组成部分。术后肛管闭合，瘘管切口的两端很容易触碰在一起，如果长时间没有采取措施，瘘管腔并未完全肉芽填充而两端的皮肤会先生长到一起，这样的愈合形式叫桥形愈合，由于不是真正的愈合，还会造成复发，所以又叫假愈合。因此在换药时不仅要用油沙条填塞瘘管腔，还要用油沙将断端两侧的肛管皮肤隔开。